毛发学认为，斑秃的真正发病原因尚不清楚，特别是全秃、普秃，或者是葡行型、蛇型这样的斑秃顽疾，更是需要医学进一步探索，去发现真正原因，只有找到原头，临床才能突破这类斑秃的治疗瓶颈。
虽然没有找到真正原因，但医学根据大量患者临床数据，也会发现一些规律，特别是在某些患者斑秃发生的同时，身体局部器官也会出现一些异常现象：
一、指甲异常：指甲呈现出凹陷、斑点、营养不良现象。
指甲的营养不良表现形式为甲板变薄或者增厚，浑浊、变形、易断、粗糙、无光泽。甲营养不良有先天性与后天两种因素：后天性由缺乏维生素、缺铁性贫血导致；也可由一些急性传染病引发机体营养不良导致；也可以由一些慢性消耗性疾病造成，比如甲状腺机能低下、中毒、肝病、血液循环障碍、肺功能不良等；也有一些银屑病、偏平苔癣、梅毒、硬皮病、毛囊角化、恶性斑秃等皮病导致。
二、过敏性疾病：过敏性鼻炎、遗传性过敏性皮炎、哮喘、荨麻疹等疾病。
三、自身免疫性疾病：比如桥本甲状腺炎、溃疡性结肠炎、恶性贫血、白癜风等。
四、遗传性疾病：如唐氏综合征大都容易出现斑秃情况。
五、其它如一些白内障病人也容易与斑秃相随。
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以上只是分析一些斑秃常伴随某些疾病的规律，那么，到底是斑秃引发这些疾病，还是这些疾病导致斑秃呢，也就是说斑秃真正的原因是什么，至今为止，医学并没有完全给出一个真正有力的结论，只是怀疑与免疫系统有关，但下面一些因素导致斑秃，是可以确认的：
精神因素：临床发现，许多斑秃患者在出现初次斑秃，或者斑秃加重之前，大都伴有精神紧张、惊恐；压力、失眠、抑郁；劳累、重大变故等现象。
遗传过敏性因素：从一些斑秃伴有哮喘、荨麻疹、过敏性鼻炎、湿疹的数据来看，这类斑秃具备家族性倾向，并常对鱼、虾、牛奶、鸡蛋等有过敏反应。这类型斑秃在血液检测时，常发现血清中反应素升高、血液中嗜酸性白细胞增多。
大量临床证实，过敏性因素导致的斑秃比率非常大，特别是少年儿童群体，常伴有湿疹与哮喘，也非常容易发展为全秃。一些有经验的皮肤科医生给少儿诊断斑秃原因的时候，常将“阳性皮肤实验”，“遗传过敏”作为诊断依据，一些临床案例也证实：这类遗传过敏性质的斑秃，治疗起来，难度也大，愈后欠佳。
免疫性因素：免疫性疾病分为“器官特异性自身免疫病”与“系统性自身免疫病”两种类型。斑秃患者常伴有以上一种或两种，其斑秃的发病率也明显高于一般人群。
遗传因素：斑秃患者中，约10%～20%的人群有家庭史，其中“唐氏综合症”疾病中，斑秃发生率普遍增高。
综上所述，发生斑秃的原因有多种，治疗时，必须弄清楚每一个斑秃的真正原因，才能做到有的放矢，选择最佳治疗方案。
